口袋妖怪红蓝宝石复刻里的神兽最多，单机可以抓到许多前作神兽，也可以通过网络交换到其他神兽。红蓝宝石复刻里可直接捕获的神兽：水君、雷皇、炎帝、凤凰、路基亚、冰神柱、岩神柱、钢神柱、拉提欧斯、拉提亚斯、海皇牙、古拉顿、裂空座、迪奥西斯、黄圣菇、红圣菇、蓝圣菇、帝牙卢卡、帕路奇犽、席多蓝恩、神柱王、骑拉帝纳、美梦兽、勾帕路翁、毕力吉翁、代拉基翁、龙卷云、雷电云、土地云、雷希拉姆、捷克罗姆、酋雷姆。